Основные направления и отдельные разделы Программы ежегодно будут корректироваться с учетом эпидемиологической обстановки, результатов научных исследований, проводимых в этой области, а также социально-экономического положения страны и Омской области.
Формы и методы организации управления реализацией Программы определяются Омским областным центром Госсанэпиднадзора, Главным управлением здравоохранения Администрации области и другими заинтересованными управлениями и Комитетами Администрации области, по своим направлениям деятельности.
Общее управление и контроль за реализацией Программы осуществляет межведомственный комитет по борьбе со СПИД при Администрации области. Состав комитета утверждается распоряжением Главы Администрации Омской области. Реализация основных блоков программы осуществляется на основе межведомственных планов работы, согласованных с исполнителями и утвержденными на заседании комитета по профилактике ВИЧ-инфекции при администрации области.