Основными функциями комиссии являются:
3.1. Рассмотрение эколого-экономического обоснования использования природных ресурсов области.
3.2. Разработка и утверждение согласованных планов совместной деятельности территориальных органов.
3.3. Согласование региональных норм (нормативов), правил использования отдельных видов природных ресурсов, лимитов (квот) на их изъятия, а также правил ведения хозяйственной и иной деятельности, оказывающей воздействие на окружающую природную среду.
3.4. Подготовка предложений по разработке экологических требований для учета их в государственных стандартах, ведомственной инструктивно-методических и нормативно-технических документах.
3.5. Рассмотрение предложений органов государственной власти области и органов местного самоуправления, а также общественных объединений и граждан по вопросам охраны окружающей природной среды.
3.6. Внесение в Администрацию области предложений по совершенствованию использования, охраны и воспроизводству природных ресурсов области.
3.7. Информирование в установленном порядке органов государственной власти области и граждан о деятельности территориальных природоохранных органов.