Комитет в своей работе всегда уделял особое внимание взаимоотношениям краевого бюджета с бюджетами городов и районов края.
Все наработки по этой проблеме были обобщены и вынесены на широкое обсуждение с участием администрации края, депутатов, глав муниципальных образований на "круглый стол" в мае 2001 года.
Мнения, высказанные участниками "круглого стола" позволили выделить важнейшую проблему межбюджетных отношений в крае - несовершенный действующий механизм распределения финансовой помощи из краевого бюджета бюджетам городов и районов, при котором у муниципальных образований полностью отсутствуют стимулы для наращивания собственной доходной базы.
Для решения этой задачи комитетом был подготовлен и принят на сессии краевого Совета народных депутатов Закон "О внесении изменений и дополнений в закон Алтайского края "О бюджетном устройстве, бюджетном процессе и финансовом контроле в Алтайском крае", в котором глава "Межбюджетные отношения" полностью изложена в новой редакции.
Данным нормативным правовым актом предусмотрено введение единых подходов для всех муниципальных образований при определении объема дотации местным бюджетам на основе краевых нормативов минимальной бюджетной обеспеченности и создание краевого фонда стимулирования экономического развития муниципальных образований, достигнувших наибольших успехов в повышении уровня собственных доходов.