Контроль за реализацией Программы осуществляется департаментом здравоохранения области и первым заместителем Губернатора области, курирующим отрасль "Здравоохранение".
Департамент здравоохранения несет ответственность за конечные результаты исполнения Программы, целевое и эффективное использование выделяемых средств, подготовку и представление аналитической информации.