Финансовый контроль за исполнением областного бюджета и бюджетов муниципальных образований осуществляют финансовые органы области и муниципальных образований в соответствии с Бюджетным кодексом Российской Федерации.
Финансовый контроль в части использования бюджетных средств, полученных из областного бюджета, контроль за исполнением бюджетов территориальных государственных внебюджетных фондов осуществляется департаментом финансов области и Контрольно-ревизионным управлением Министерства финансов Российской Федерации в Вологодской области в соответствии с заключенным соглашением.