Прекращение деятельности Департамента осуществляется в виде его ликвидации или реорганизации (слияние, присоединение, разделение, выделение, преобразование в иную организационно-правовую форму) постановлением Администрации Тверской области в установленном законодательством Российской Федерации порядке.
Имущество Департамента в случае его ликвидации передаётся его собственнику в лице уполномоченного государственного органа.