Обеспечение условий развития инноваций в Республике Башкортостан основывается на выделении следующих направлений:
функциональная поддержка развития инновационной деятельности;
поддержка приоритетных направлений инновационной деятельности и кластерных инициатив;
территориальное развитие инноваций.
Инновационная деятельность в Республике Башкортостан развивается активными темпами. В 2013 году крупными и средними предприятиями обрабатывающей промышленности отгружено товаров собственного производства, выполнено работ и услуг собственными силами инновационного характера на 50,6 млрд. рублей (112,3% по отношению к 2012 году).
По результатам проведенного в 2013 году исследования Национальной ассоциации инноваций и развития информационных технологий (НАИРИТ) Республика Башкортостан относится к регионам с высокой инновационной активностью и занимает 11 место в стране.
Башкортостан входит в состав Ассоциации инновационных регионов России.
В республике реализуется смешанная модель инновационного развития. Генерация новых знаний осуществляется как за счет вузовской, научной сферы, так и научных подразделений предприятий.
В Республике Башкортостан действуют 7 технопарков, 3 индустриальных парка, инновационный бизнес-инкубатор, 3 центра трансфера технологии, венчурный фонд, 22 инновационных предприятия при вузах и научных организациях, центр коллективного пользования уникальным научным оборудованием "Агидель", производственно-технологические центры субъектов малого предпринимательства. Общая численность работающих на объектах превышает 1,7 тыс. человек. Количество патентов, освоенных в производственной деятельности, - 13, число резидентов технопарков - 42.
В 2013 году начато создание центров молодежного инновационного творчества по модели "FAB LAB" (на апрель 2014 года их создано 3), в феврале 2014 года открыты Центр коллективного доступа к высокотехнологичному оборудованию радиоэлектронного кластера Республики Башкортостан, Центр коллективного доступа к высокотехнологичному оборудованию кластера малотоннажной нефтехимии и Региональный центр инжиниринга.
В целях создания и обеспечения деятельности инфраструктуры поддержки субъектов инновационной деятельности ведется работа по созданию и развитию:
индустриальных парков "Прикамье" в г. Нефтекамске, "Строительные материалы Башкортостана" в г. Агидели, "Салават" в г. Салавате, "ХимТерра" в г. Благовещенске на базе ОАО "Полиэф", индустриальный парк в Уфимском районе, Первый Зауральский Индустриальный парк в г. Сибае, "ГлавБашСтрой" в Уфимском районе, "Промцентр" в микрорайоне Шакша;
технопарка по энергосбережению и энергоэффективности совместно с ОАО "РусГидро".
Для реализации кластерной политики создан Центр кластерного развития. Принято решение о формировании кластеров химии и биотехнологий для сельского хозяйства, легкой и сверхлегкой авиации, фармацевтической и медицинской промышленности, информационных технологий, нефтесервисного, научно-производственного кластера наноматериалов и производства изделий из них.
В республике действует Фонд содействия развитию венчурных инвестиций в малые предприятия в научно-технической сфере. На данный момент профинансировано 8 проектов на общую сумму 271 млн. рублей.
С 2007 года работает Совет по научно-технической и инновационной политике при Правительстве Республики Башкортостан.
В вузах республики функционируют более 50 инновационных структур, среди крупнейших - технопарки Башкирского государственного университета и Уфимского государственного авиационного технического университета. В ряде вузов ведется работа по созданию малых предприятий и индустриальных парков.