Основными задачами республиканских отраслевых комиссий являются:
1) ведение коллективных переговоров, подготовка проектов соглашений, разработка и заключение республиканских отраслевых соглашений;
2) оказание методической и практической помощи сторонам республиканских отраслевых комиссий при заключении территориальных соглашений и коллективных договоров;
3) осуществление контроля и принятие мер, направленных на выполнение условий республиканских отраслевых соглашений;
4) подготовка и внесение в Правительство Республики Башкортостан предложений по разработке проектов нормативных правовых актов, направленных на развитие отрасли, предоставление гарантий и льгот работникам отрасли;
6) содействие разрешению конфликтных ситуаций, возникающих в сфере социально-трудовых и связанных с ними экономических отношений в отрасли;
7) взаимодействие с Республиканской трехсторонней комиссией и другими органами социального партнерства.