Здесь проходят восточные и южные границы многих европейских древесных видов, западные границы сибирских, а также северные границы некоторых степных растений. Несмотря на то, что по своему географическому положению Республика Башкортостан находится в зонах широколиственных и хвойно-широколиственных лесов, фактическое их распространение не соответствует географическому положению. Полоса степей заходит гораздо дальше на север, чем в других районах европейской части России, а леса Уральскими горами продвинуты вглубь зоны разнотравных степей.
Как следствие горизонтальной зональности и вертикальной поясности породный состав лесов представлен светлохвойными, темнохвойными, широколиственными, мелколиственными и смешанными лесами.
Разнообразие типов условий местопроизрастания и богатый ассортимент древесных пород формирует сложные по составу древостои. Здесь представлены практически все типы лесов, а в живом напочвенном покрове наблюдается обилие и пестрота растительности.
Естественные леса Башкирии образованы 20 древесными породами, многие из которых являются ценными как в хозяйственном, так и в экологическом отношении (рисунок 3). Прежде всего это хвойные породы - сосна обыкновенная, лиственница Сукачева, ель сибирская и пихта сибирская. Основная часть сосновых лесов сосредоточена в горах Южного Урала и низовьях реки Белой. Сосняки играют значительную роль в гидрологическом режиме Южного Урала и примыкающих к нему пространств. Лиственница Сукачева весьма близка по строению и биологии к лиственнице сибирской. Хищнические рубки прошлого века явились причиной резкого сокращения ее площадей. В настоящее время все без исключения лиственничники и даже отдельные деревья охраняются законом, полностью запрещающим какие-либо рубки. К сожалению, у лиственницы Сукачева имеется один существенный биологический недостаток: урожаи ее семян, как правило, скудны, качество семян низкое, высока их повреждаемость насекомыми. К числу ценных пород-лесообразователей относится и ель сибирская. Достаточно часто, особенно в лесах Уфимского плато, встречаются естественные гибриды этого вида с елью обыкновенной, отличающиеся большей длиной шишек, вытянутостью и зазубренностью семенных чешуй. Зачастую совместно с елью растет и пихта сибирская. Пихта отличается более быстрым ростом, но меньшей долговечностью. Ее древесина менее устойчива к гнили. Пихта более активно, чем ель, внедряется в широколиственные леса, образуя чаще всего с липой смешанный древостой. Пихтово-еловые леса в Башкирии сосредоточены на Уфимском плато (бассейн р. Уфы), в высокогорьях Южного Урала и в Камско-Бельско-Таныпском междуречье. Важную роль в образовании лесов Башкирии играют и такие ценные древесные породы как дуб черешчатый и липа мелколистная, которые вместе с подлесочными кустарниками - лещиной, бересклетом бородавчатым, жимолостью лесной создают сложные лесные экосистемы с высоким биоразнообразием. Липняки в Башкортостане находятся под защитой, рубки их заметно ограничены в интересах пчеловодства.
Разнообразие лесорастительных условий обусловило широкий диапазон распределения насаждений по классам бонитета: здесь встречаются древостои от Iа до Vа классов бонитетов, однако преобладают леса III класса бонитета. На их долю приходится 44,3% покрытой лесной растительностью площади. Насаждения II класса бонитета занимают 23,3%, IV - 22,2%, I - 4,5%, V - 4,3%, Vа - 0,8% и Iа - 0,6%.
В результате посадки лесных культур быстрорастущих пород, увеличения доли молодняков мягколиственных пород средний класс бонитета насаждений за последние годы увеличился на 0,1 - 0,3. Вырубка наиболее производительных насаждений, торможение роста культур из-за заглушения второстепенными породами несколько нивелируют эти показатели. Полнота насаждений в среднем равна 0,64. Низкополнотные (0,3 - 0,4) занимают 11,7%, среднеполнотные (0,5 - 0,7) - 64,1%, высокополнотные (0,8 - 1,0) - 24,2% покрытой лесом площади. Наиболее низкая полнота у лиственничников, еловых и сероольховых насаждений. Самая высокая полнота в древостоях осины и в лесных культурах сосны. Средняя полнота равнинных лесов выше, чем горных.