Основными задачами Министерства являются:
2.1. Разработка предложений по координации и регулированию деятельности в области международных и внешнеэкономических связей Республики Башкортостан, межрегиональных связей с субъектами Российской Федерации, внутренней торговли, общественного питания, их реализация.
2.2. Обеспечение международных связей Республики Башкортостан с органами государственной власти иностранных государств, субъектами иностранных федеративных государств, административно - территориальными образованиями иностранных государств, международными организациями и межрегиональных связей с субъектами Российской Федерации.
2.3. Разработка в установленном порядке предложений о заключении соглашений Республики Башкортостан об осуществлении международных и внешнеэкономических связей, обеспечение выполнения обязательств Республики Башкортостан по этим соглашениям, а также наблюдение за выполнением другими участниками соглашений их обязательств.
2.4. Участие в совершенствовании форм и методов государственной поддержки организаций и предпринимателей республики в вопросах развития внешнеэкономических и межрегиональных связей, торговли и общественного питания.
2.5. Обеспечение взаимодействия с федеральными органами исполнительной власти, а также с находящимися на территории Республики Башкортостан их структурными подразделениями по вопросам, входящим в компетенцию Министерства.
2.6. Координация и регулирование деятельности в области международных, внешнеэкономических и межрегиональных связей, внутренней торговли и общественного питания.
2.7. Разработка и координация мер по привлечению иностранных инвестиций, участие в их размещении на территории Республики Башкортостан.
2.8. исключен на основании Указа Президента РБ от 30 декабря 2005 года №УП-717.
2.9. Участие в реализации мер по государственной поддержке экспорта, развитии экспортного потенциала Республики Башкортостан и оптимизации его структуры, содействие развитию экспортоориентированных и импортозамещающих производств.
2.10. Продвижение продукции республиканских товаропроизводителей на внешние рынки.