Республиканские органы исполнительной власти в пределах ведения Российской Федерации и полномочий Российской Федерации по предметам совместного ведения Российской Федерации и Республики Башкортостан входят в единую систему исполнительной власти в Российской Федерации.
Нормативные правовые акты соответствующих федеральных органов исполнительной власти, принятые по предметам ведения Российской Федерации и по полномочиям Российской Федерации по предметам совместного ведения Российской Федерации и Республики Башкортостан, являются обязательными для республиканских органов исполнительной власти.