2.1. Организация и осуществление государственного сортового и семенного контроля в отношении посевов и семян сельскохозяйственных растений, проведение сертификации семенного и посадочного материала.
2.2. Контроль за выполнением физическими и юридическими лицами, осуществляющими деятельность в области семеноводства, районными государственными семенными инспекциями законодательных и иных нормативных правовых актов по вопросам сортового контроля.
2.3. Определение сортовых качеств семян методом апробации посевов, лабораторного сортового контроля.
2.4. Определение посевных качеств семян посредством проведения отбора проб семян и их анализа.
2.5. Организация и проведение работ по обязательной сертификации семян, подлежащих реализации.
2.6. Выдача официальных документов, удостоверяющих качество семян.
2.7. Контроль за соблюдением международных правил при транспортировании, хранении, отборе проб семян при экспортно-импортных поставках.
2.8. Обеспечение правильного применения государственных стандартов и международных правил определения сортовых и посевных качеств семенного и посадочного материала для внутреннего рынка и экспортных поставок.
2.9. Организация своевременной проверки посевных качеств семян в районных государственных семенных инспекциях и принятие мер по результатам проверки.
2.10. Контроль за применением единых методов, терминологии и нормативной документации по семеноводству при определении сортовых и посевных качеств семян.
2.11. Контроль за точностью применения государственными семенными инспекциями установленных методов анализа и соблюдением правил оформления документации на семена.
2.12. Оказание помощи районным государственным семенным инспекциям в укомплектовании их квалифицированными кадрами и содействие им в обеспечении помещениями, отвечающими условиям для аналитической работы.
Организация снабжения необходимым лабораторным оборудованием, материалами, реактивами и бланками документации на семена.
Планирование строительства зданий инспекций и жилищного фонда государственной службы семенного контроля, контроль за их целевым использованием.
2.13. Организация повышения квалификации специалистов районных государственных семенных инспекций.
2.14. Представление Министерству сельского хозяйства и продовольствия Республики Башкортостан информации о качестве семян в республике и предложений по повышению их качества.
2.15. Создание в районных государственных семенных инспекциях информационного банка данных о сортах сельскохозяйственных культур, включенных в государственный реестр.
2.16. Проведение арбитражных, контрольных, проверочных, сличительных, на тождественность и других особо сложных видов анализа семян.
2.17. Осуществление контроля за использованием сортов семян и посадочного материала.
2.18. Контроль за использованием семян охраняемых сортов.
2.19. Контроль за ведением производителями семян документации на семена, учета количества, качества и происхождения семян.