1. Административно-контрольное управление
2. Государственно-правовое управление
3. Представительство Правительства Ярославской области при Правительстве Российской Федерации
4. Управление государственной службы и кадровой политики
5. Управление делами
6. Управление ЗАГС
7. Управление информационных ресурсов
8. Управление массовых коммуникаций
9. Управление по взаимодействию с законодательными органами
10. Управление по делам архивов
11. Управление по противодействию коррупции
12. Управление по социальной и демографической политике
13. Управление стратегического планирования
14. Финансовое управление