Ведение Красной книги Ярославской области включает:
- сбор и анализ информации об объектах животного и растительного мира;
- организацию мониторинга состояния объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Ярославской области;
- создание и пополнение банка данных об объектах животного и растительного мира;
- занесение в Красную книгу Ярославской области (или исключение из нее) объектов животного или растительного мира в установленном порядке;
- подготовку к изданию, издание и распространение Красной книги Ярославской области;
- подготовку и реализацию предложений по специальным мерам охраны, включая организацию особо охраняемых природных территорий и генетических банков, а также разработку и внедрение других мероприятий с целью сохранения объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Ярославской области;
- выдачу разрешений на добывание объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Ярославской области, кроме объектов, включенных в Международную Красную книгу и Красную книгу Российской Федерации;
- регистрацию центров по разведению и содержанию объектов животного и растительного мира, занесенных в Красную книгу Ярославской области.
- разработку программ по охране объектов животного и растительного мира и среды их обитания.