Комплексное управление Программой осуществляет в соответствии с действующим законодательством государственный заказчик - координатор Программы - Администрация Ярославской области в лице департамента АПК. Департамент АПК с целью реализации Программы:
- осуществляет текущее управление и контроль за ходом ее реализации, а также координацию работы исполнителей программных мероприятий;
- заключает в установленном порядке договоры и контракты с исполнителями;
- проводит согласование объемов финансирования;
- в соответствии со своей компетенцией участвует в финансировании мероприятий;
- в соответствии с установленным порядком вносит предложения о ее корректировке, в том числе по содержанию мероприятий, исполнителям, объемам и источникам финансирования;
- осуществляет сбор материалов, подготовку и представление в установленном порядке отчетов о ходе ее реализации и расходовании бюджетных средств;
- осуществляет подготовку проектов постановлений Администрации Ярославской области, других нормативных правовых актов.
В своей работе государственный заказчик - координатор Программы руководствуется Конституцией Российской Федерации, Гражданским кодексом Российской Федерации, федеральными законами и законами Ярославской области, постановлениями Правительства Российской Федерации, другими нормативными правовыми актами Российской Федерации и Ярославской области.
Финансовый контроль целевого использования выделяемых бюджетных средств осуществляется в установленном порядке уполномоченными органами.