Государственный заказчик Программы осуществляет общее руководство и контроль за выполнением Программы, координирует взаимодействие органов исполнительной власти области по вопросам обеспечения жильем молодых семей, оказывает содействие органам местного самоуправления по разработке и реализации мероприятий муниципальных программ обеспечения жильем молодых семей.
Генеральная управляющая компания Программы действует на основании договора, заключенного с ней государственным заказчиком Программы. Условия договора определяются государственным заказчиком Программы по согласованию с министерством финансов области и министерством экономического развития и торговли области.
Отчеты о результатах реализации Программы в установленные сроки представляются генеральной управляющей компанией Программы государственному заказчику, в областную Думу, министерство финансов области, министерство экономического развития и торговли области и Агентство регионального развития при Губернаторе области.