Ответственным за реализацию Программы является ее государственный заказчик- Правительство области.
Реализация Программы осуществляется на основе государственных контрактов (договоров), заключаемых министерством здравоохранения области с исполнителями программных мероприятий.
Государственный заказчик обеспечивает в ходе реализации Программы координацию деятельности основных исполнителей, контролирует целенаправленное и эффективное использование ассигнований и выполнение намеченных мероприятий; формирует совместно с основными исполнителями Программы сводную бюджетную заявку; предусматривает в ней объемы ассигнований на последовательную реализацию мероприятий Программы; ежегодно представляет ее в министерство экономики области и министерство финансов области для учета при формировании проектов годовых прогнозов социально-экономического развития области и областного бюджета; принимает возможные меры по полному финансированию Программы.
Основные исполнители Программы разрабатывают и утверждают ежегодные планы работ по выполнению соответствующих мероприятий; осуществляют организацию, контроль и обеспечение выполнения в полном объеме предусмотренных Программой работ; подготавливают и направляют государственному заказчику предложения к сводной бюджетной заявке с указанием конкретных мероприятий в стоимостных и натуральных показателях с соответствующими обоснованиями.
Исполнители отдельных мероприятий Программы - предприятия, учреждения, организации - определяются на конкурсной основе в соответствии с Федеральным законом «О конкурсах на размещение заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных нужд».
Предусматривается активное привлечение средств фондов общественных организаций, другие поступления. В ходе реализации Программы министерством здравоохранения области будут осуществляться мероприятия по формированию договоров с международными организациями в целях привлечения финансовых средств для осуществления совместных проектов по укреплению материально-технической базы службы, внедрению новых технологий лабораторной диагностики, обеспечению лекарственными средствами и средствами профилактики, а также по развитию сотрудничества и кооперации на взаимовыгодной основе с государствами - участниками Содружества Независимых Государств.