Организация управления Программой включает:
стратегическое планирование (определяет стратегию, качество, темпы и пропорции развития индустриально-энергетического комплекса области в целом, а также важнейших межотраслевых и отраслевых комплексов);
организационные структуры управления Программой (отражают состав и согласованность различных элементов, звеньев и ступеней хозяйственного управления, участвующих в реализации Программы);
экономические рычаги воздействия (включают финансово - кредитный механизм реализации Программы, материально-техническое обеспечение, стимулирование программных мероприятий);
правовые рычаги воздействия (включают совокупность нормативных документов, регулирующих отношения федеральных и областных органов государственной власти, заказчиков и исполнителей в процессе реализации программных мероприятий и конкретных проектов с учетом законодательства области).
Контроль за выполнением Программы возлагается на министерство промышленности области, которое по итогам каждого года информирует Правительство области о ходе реализации Программы.
Министерство промышленности области совместно с заинтересованными министерствами и ведомствами области координирует работу исполнителей, финансирование мероприятий Программы, осуществляет контроль за эффективностью использования выделяемых средств.