Управление реализацией программы осуществляется Комитетом по вопросам местного самоуправления Администрации области. Исполнители мероприятий программы несут ответственность за их качественное и своевременное выполнение, рациональное использование выделяемых на реализацию программных мероприятий средств.
Субъекты выполнения мероприятий, указанные в графе "Исполнители" Перечня мероприятий программы первыми, являются ответственными за выполнение мероприятий. Они могут создавать межведомственные группы, работу которых организуют и контролируют два раза в год - к 10 января и 10 июля представляют в Комитет по вопросам местного самоуправления Администрации области отчеты в виде справок о ходе выполнения мероприятий программы с указанием порядкового номера мероприятия и анализом эффективности использования выделяемых финансовых средств.
Ход и результаты выполнения мероприятий программы рассматриваются на совещаниях у заместителя Губернатора области - Руководителя Аппарата Администрации области, координирующего деятельность Комитета по вопросам местного самоуправления Администрации области, один раз в полугодие (по решению Губернатора области или заместителя Губернатора области - Руководителя Аппарата Администрации области - на внеочередном совещании) с заслушиванием отчетов руководителей субъектов выполнения мероприятий - исполнителей программы.