Основными задачами Управления являются:
2.1. Участие в реализации федеральных целевых программ по предупреждению и ликвидации карантинных и особо опасных (по перечню, устанавливаемому федеральным органом исполнительной власти в области нормативно-правового регулирования в ветеринарии) болезней животных, включая сельскохозяйственных, домашних, зоопарковых и других животных, пушных зверей, рыб и пчел, и осуществление областных планов ветеринарного обслуживания животноводства.
2.2. Реализация областных целевых программ в области ветеринарии, в том числе по профилактике и ликвидации инфекционных и инвазионных заболеваний сельскохозяйственных животных в хозяйствах всех форм собственности.
2.3. Контроль за соблюдением органами исполнительной власти области и должностными лицами, организациями, иными хозяйствующими субъектами, общественными объединениями, международными организациями, гражданами-владельцами животных и производителей продуктов животноводства ветеринарного законодательства Российской Федерации.
2.4. Осуществление государственного ветеринарного надзора, обеспечение безопасности продуктов животноводства в ветеринарно-санитарном отношении.
2.5. Защита населения от болезней, общих для человека и животных.
2.6. Осуществление в пределах своих полномочий охраны территории области от заноса заразных болезней животных, в том числе из иностранных государств.