Государственный заказчик осуществляет координацию деятельности исполнителей в ходе реализации программы, ее методическое обеспечение.
Государственный заказчик программы обеспечивается из бюджета Забайкальского края финансовыми ресурсами в объеме, установленном законом о краевом бюджете на очередной финансовый год.
Государственный заказчик программы с учетом выделяемых на реализацию программы финансовых средств и анализа реализации мероприятий программы ежегодно может вносить предложения об уточнении перечня мероприятий программы и затрат на их выполнение, целевых показателей, механизма реализации программы, состава их участников. Порядок предоставления средств бюджета Забайкальского края на оказание государственной поддержки сельскохозяйственным товаропроизводителям (кроме граждан, ведущих личное подсобное хозяйство) в виде субсидий на возмещение части затрат на реализацию программных мероприятий устанавливается Правительством Забайкальского края. Обязательное условие предоставления государственной поддержки - гарантия сохранности мелиоративных систем и их эффективного использования.
Государственный заказчик программы ежегодно до 10 января года, следующего за отчетным годом, представляет в Министерство территориального развития Забайкальского края доклад о ходе выполнения мероприятий программы и эффективности использования финансовых средств.
Контроль за ходом выполнения мероприятий программы осуществляют Министерство территориального развития Забайкальского края и заместитель председателя Правительства Забайкальского края по финансово-экономическим вопросам.