В настоящее время общая площадь ООПТ в Забайкальском крае составляет 3,95% его общей площади.
На территории Забайкальского края расположены 2 государственных природных заповедника (государственный природный биосферный заповедник "Даурский" и Сохондинский государственный природный биосферный заповедник), национальный парк "Алханай", 2 государственных природных заказника федерального значения ("Цасучейский бор" и "Буркальский"), 12 государственных природных заказников регионального значения (2 из которых являются комплексными, 10 - биологическими) и 64 памятника природы.
ООПТ регионального значения занимают около 3% территории края.
Анализ имеющихся материалов по памятникам природы и выборочное их обследование показали, что отдельные памятники природы по разным причинам не соответствуют требованиям, предъявляемым к ним законодательством Российской Федерации. В связи с этим необходимо в ближайшее время провести инвентаризацию всех памятников природы регионального значения, выявить не соответствующие своему назначению и вывести их из данной категории ООПТ. По остальным памятникам природы необходимо уточнить их состояние, границы, собственников, владельцев и пользователей земель, на территории которых находятся памятники природы, оформить в установленном порядке документацию на эти объекты, включая охранные обязательства.
Недостаточность финансирования ООПТ и несовершенство природоохранного законодательства осложняют осуществление государственного управления ранее образованными в Забайкальском крае ООПТ регионального значения. Недостаток средств не позволяет оснастить работников службы охраны государственных природных заказников эффективными средствами связи, приборами дистанционного наблюдения, форменным обмундированием, полевым и специальным снаряжением. Частично проблемы развития материально-технической базы ООПТ предполагается решить за счет средств краевой долгосрочной целевой программы "Развитие системы особо охраняемых природных территорий в Забайкальском крае (2012-2016 годы)".