Эффективность от реализации программных мероприятий следует рассматривать в экологическом и социально-экономическом аспектах.
В экологическом аспекте эффективность достигается за счет снижения антропогенной нагрузки на уязвимые экосистемы, рационального использования природных ресурсов в границах ООПТ. Образование новых ООПТ целесообразно рассматривать, кроме прочего, в качестве компенсационных мероприятий при строительстве промышленных объектов.
Реализация мероприятий программы не повлечет за собой негативных экологических последствий и, более того, благоприятно скажется на природных комплексах Забайкальского края. Реализация программы направлена на сохранение ненарушенных хозяйственной деятельностью природных комплексов. В Забайкальском крае будет создано 5 новых ООПТ, в которые войдут эталонные участки ландшафтов, репрезентативных для Восточного Забайкалья.
Снижение антропогенной нагрузки на природные комплексы ООПТ будет достигаться за счет создания условий для организованного (регулируемого) туризма и рекреации. Планируется строительство туристской базы в модельной рекреационной зоне проектируемого природного парка «Ивано-Арахлейский» на побережье озера Большой Ундугун, 2 информационных центров в природных парках «Ивано-Арахлейский» и «Озеро Арей», обустройство 175 рекреационных стоянок и 35 экологических троп.
Развитию экологического просвещения и воспитания, приобщению населения к бережному отношению к природе будет способствовать издание эколого-просветительской продукции о природных комплексах и ценности ООПТ. Будет издано не менее 7500 экземпляров издательской продукции, изготовлено не менее 2500 штук сувенирной продукции, снято 3 научно-популярных фильма, ООПТ будут обеспечены информационными аншлагами.
Реализация программы позволит в целях обеспечения санитарной безопасности водных объектов создать систему очистных сооружений в пяти крупных населенных пунктах Забайкальского края, расположенных в бассейне озера Байкал.
Социально-экономический эффект заключается в сохранении природных ландшафтов, которые представляют собой природную и эстетическую ценность, невыразимую в денежном эквиваленте, а также генофонда живых организмов Забайкалья; обогащении смежных с ООПТ охотничьих угодий ценными промысловыми видами животных; повышении благосостояния населения; улучшении работы по экологическому просвещению и воспитанию посетителей ООПТ и местного населения.
В экономическом аспекте эффективность достигается за счет создания новых производств и предоставления новых видов услуг (в том числе экологических), развития туризма на ООПТ как высокорентабельной и доходной отрасли экономики.