Управление программой осуществляет государственный заказчик программы, который ежегодно в установленном порядке направляет в Министерство территориального развития Забайкальского края бюджетную заявку на выделение ассигнований из краевого бюджета для финансирования мероприятий в очередном финансовом году.
Государственный заказчик программы подготавливает ежегодно в установленном порядке перечень финансируемых мероприятий программы, определяет объемы их финансирования, а также механизм реализации программы; обеспечивает своевременное использование выделенных денежных средств, выполнение мероприятий программы; направляет в Министерство территориального развития Забайкальского края отчетную информацию о ходе реализации программы и эффективности использования финансовых средств.
Реализация мероприятий программы осуществляется путем размещения государственных заказов в установленном федеральным законодательством порядке.
Контроль за ходом выполнения мероприятий программы осуществляют заместитель председателя Правительства Забайкальского края по социальным вопросам и Министерство территориального развития Забайкальского края.