Организацию выполнения программных мероприятий осуществляет Государственный заказчик.
Государственный заказчик подготавливает заявку на предоставление финансовой поддержки за счет средств Фонда в пределах лимита, установленного для Забайкальского края. Губернатор Забайкальского края подает в Фонд заявку на 2009 год на предоставление финансовой поддержки за счет средств Фонда.
Реализация программы осуществляется путем предоставления жилых помещений гражданам, переселяемым из занимаемых по договорам социального найма жилых помещений в признанных аварийными многоквартирных домах, либо путем предоставления жилых помещений гражданам по договорам мены.
Основная часть мероприятий программы реализуется органами местного самоуправления муниципальных образований, являющихся участниками программы, путем размещения государственных заказов в порядке, установленном Федеральным законом. Организации, отобранные органами местного самоуправления в соответствии с Федеральным законом от 21 июля 2005 года № 94-ФЗ «О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд» реализуют программу путем строительства жилых домов.
Реализация настоящей программы также предусматривает участие муниципальных образований в приобретении помещений на рынке жилья.
Контроль за реализацией мероприятий программы осуществляется в соответствии с Федеральным законом.