Управление реализаций Программы осуществляет заказчик Программы -Управление ТЭК и природных ресурсов Читинской области. Формы и методы организации управления реализацией Программы определяет заказчик.
Текущее управление реализацией Программы осуществляют Управление ТЭК и природных ресурсов Читинской области, ГУПР и охраны окружающей среды МПР России по Читинской области под руководством заместителя Главы Администрации (Губернатора) Читинской области по топливно-энергетическому комплексу и горно-рудной промышленности. Управление ТЭК и природных ресурсов Читинской области, ГУПР и охраны окружающей среды МПР России по Читинской области организуют проведение необходимых работ по привлечению внебюджетных средств для реализации Программы.
Заказчик Программы с учетом выделяемых на ее реализацию финансовых средств ежегодно уточняет целевые показатели и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации Программы, состав исполнителей и представляет в Комитет экономики Читинской области и Комитет по финансам Читинской области проекты бюджетных заявок.
Между заказчиком и предполагаемыми исполнителями заключаются договоры на выполнение работ по воспроизводству лесов. Отбор исполнителей каждого программного мероприятия осуществляется заказчиком в соответствии с федеральным законом и законом области (преимущественно на конкурсной основе).
Контроль за выполнением Программы осуществляют Комитет экономики Читинской области, Комитет по финансам Читинской области, Управление ТЭК и природных ресурсов Читинской области в порядке, установленном Главой Администрации (Губернатором) Читинской области для контроля за реализацией областных программ.
Комитет по финансам Читинской области, Управление ТЭК и природных ресурсов Читинской области, ГУПР и охраны окружающей среды МПР России по Читинской области с участием других органов и заинтересованных организаций осуществляют комплексные проверки хода реализации программных мероприятий. По результатам комплексных проверок подготавливаются для представления Администрации Читинской области предложения о целесообразности продолжения работ и финансирования Программы или об их прекращении, применении санкций к участникам реализации Программы.