Управление реализацией Программы осуществляется заказчиком Программы - Комитетом сельского хозяйства и продовольствия Читинской области.
Комитет сельского хозяйства и продовольствия Читинской области в установленном порядке передает функции заказчика ФГУ "Управление мелиорации, химизации земель и сельскохозяйственного водоснабжения по Читинской области" на основе заключаемых с ним соглашений, в которых определяются объемы соответствующих мероприятий и источники их финансирования, перечень хозяйств и объектов, где намечается выполнение программных мероприятий.
С учетом выделяемых на реализацию Программы средств ежегодно уточняются целевые показатели, объемы работ, организуется в установленном порядке оформление бюджетных заявок на выделение ассигнований из федерального и областного бюджетов для финансирования мероприятий Программы в очередном финансовом году и соответствующих договоров с исполнителями.
Реализация программных мероприятий обеспечивается на основе договоров, заключаемых с исполнителями, определяемыми на конкурсной основе.
Контроль за реализацией Программы осуществляют Комитет экономики Читинской области и заместитель Главы Администрации (Губернатора) Читинской области - председатель Комитета сельского хозяйства и продовольствия Читинской области через заказчика Программы. Задачей контроля за реализацией Программы являются обеспечение выполнения предусмотренных в ней показателей, соблюдения собственниками, владельцами, пользователями требований законодательства Российской Федерации при осуществлении хозяйственной деятельности в части сохранения и повышения плодородия почв земель сельскохозяйственного назначения, целевое использование средств.
Для осуществления контроля за выполнением Программы Комитет сельского хозяйства и продовольствия Читинской области, ФГУ "Управление мелиорации, химизации земель и сельскохозяйственного водоснабжения по Читинской области" в установленном порядке представляют отчеты об исполнении Программы в Комитет экономики Читинской области, в Комитет по финансам Читинской области и Читинский областной комитет государственной статистики в установленном порядке.
Проверки хода реализации программы осуществляются в соответствии с действующим законодательством.