Управляет программой заказчик программы - Комитет сельского хозяйства и продовольствия Читинской области, который при необходимости осуществляет ее корректировку.
Статус программы и многопрофильность решаемых ею задач являются основанием для организации самостоятельного органа, руководящего процессом ее управления и реализации. Для реализации программы создан Фонд развития жилищного строительства Читинской области. В своей деятельности Фонд подотчетен заказчику программы и попечительскому совету, созданному распоряжением Главы Администрации Читинской области от 6.10.1998 № 982-р.
Контроль за ходом выполнения мероприятий программы осуществляет Комитет экономики Читинской области и заместитель Главы Администрации
(Губернатора) Читинской области - председатель Комитета сельского хозяйства и продовольствия.
Органам местного самоуправления муниципальных образований области рекомендуется ежемесячно информировать заказчика программы о ходе ее реализации по показателям, характеризующим состояние дел по ее выполнению:
- использование средств федерального бюджета, выделяемых в виде субсидий для индивидуального жилищного строительства в сельской местности;
- использование средств областного бюджета, выделяемых для долгосрочного кредитования сельскохозяйственных
товаропроизводителей, крестьянских (фермерских) хозяйств, работников сельскохозяйственных организаций и других жителей сельской местности;
- использование средств местных бюджетов, выделяемых для долгосрочного кредитования сельскохозяйственных товаропроизводителей, крестьянских (фермерских) хозяйств, работников сельскохозяйственных организаций и других жителей сельской местности;
- использование собственных средств крестьянскими (фермерскими) хозяйствами, работниками сельскохозяйственных организаций и другими жителями сельской местности на строительство и приобретение жилья по доступной стоимости;
- ввод общей площади жилья, построенного в результате реализации областной целевой программы.
Фонд развития жилищного строительства Читинской области представляет ежеквартально отчет о ходе реализации программы в Комитет сельского хозяйства и продовольствия Читинской области, который в установленном порядке представляет отчетную информацию в Комитет экономики Читинской области.