Управление реализацией Программы осуществляет Заказчик Программы - Администрация Читинской области. Основным управляющим органом Программы является Совет Программы.
Совет создается постановлением Главы Администрации области, подчиняется Заказчику Программы, в своей деятельности руководствуется законодательными актами Российской Федерации и Читинской области, положением о Совете Программы. Совет направляет и организует действия всех участников Программы на достижение намеченных целей, в том числе разрабатывает и реализует мероприятия по привлечению дополнительных финансовых, кредитных и материальных ресурсов.
Состав Совета формируется из числа представителей органов исполнительной и законодательной власти, других основных исполнителей Программы.
Оперативное управление Программой, включая сбор информации о ходе выполнения мероприятий и подготовку материалов для сводных отчетов, осуществляется Комитетом экономики и отраслевыми управлениями Администрации области.
Контроль за исполнением Программы осуществляет Заказчик Программы - Администрация Читинской области. Ход работы по мероприятиям и их итоги, оценка их социальной и экономической эффективности рассматриваются в установленном порядке Советом Программы и Заказчиком Программы.
С учетом выделяемых на реализацию Программы финансовых средств Администрация области при необходимости уточняет целевые показатели, в том числе включение новых проектов, затраты по программным мероприятиям, механизм реализации.