Контроль за выполнением Программы осуществляется ее исполнителями, несущими ответственность за своевременное и рациональное использование средств, выделяемых на реализацию Программы и Советом руководителей национально-культурных организаций Республики Карелия при Государственном комитете Республики Карелия по делам национальной политики. Информацию о ходе реализации Программы исполнители представляют ежегодно к 20 января в Министерство Республики Карелия по вопросам национальной политики и связям с религиозными объединениями.
Министерство Республики Карелия по вопросам национальной политики и связям с религиозными объединениями в срок до 20 февраля отчитывается о ходе выполнения Программы за предыдущий календарный год перед Главой Республики Карелия и Правительством Республики Карелия, ход реализации Программы рассматривается на заседаниях Совета представителей карелов, вепсов и финнов Республики Карелия при Главе Республики Карелия.
Министерство Республики Карелия по вопросам национальной политики и связям с религиозными объединениями по мере необходимости рассматривает вопросы, связанные с реализацией Программы при участии ее основных исполнителей. Программа корректируется ежегодно в ходе подготовки бюджета Республики Карелия на очередной финансовый год в установленном законом порядке, с учетом прогноза социально-экономического развития Республики Карелия.