В целях контроля за реализацией Программы исполнители программных мероприятий ежеквартально в срок до 5 числа месяца, следующего за отчетным, направляют отчет о ходе реализации программных мероприятий в Министерство промышленности и транспорта Ульяновской области.
В целях обеспечения взаимодействия исполнителей Программы в установленном порядке создается совет по координации Программы, состоящий из представителей Министерства экономики Ульяновской области, Министерства промышленности и транспорта Ульяновской области, открытого акционерного общества "Корпорации развития Ульяновской области", предприятий авиационного кластера. Министерство промышленности и транспорта Ульяновской области ежеквартально в срок до 20 числа месяца, следующего за отчетным, направляет отчет о ходе реализации программных мероприятий в Министерство экономики Ульяновской области для подготовки сводного отчета о ходе реализации областных целевых программ.
Текущее управление реализацией Программы осуществляется Министерством промышленности и транспорта Ульяновской области.
Контроль за ходом реализации Программы осуществляет руководитель Программы - первый заместитель Председателя Правительства Ульяновской области, курирующий вопросы промышленности и транспорта.