Рабочая группа совета выполняет следующие функции:
4.1. Собирает и обобщает заявки на выделение квот вылова (добычи) водных биоресурсов от заявителей, зарегистрированных на территории Ульяновской области.
4.2. Готовит предложения по распределению между заявителями квот на вылов водных биоресурсов.
4.3. Разрабатывает предложения по оперативному решению вопросов эффективного и рационального использования, сохранения и воспроизводства водных биоресурсов, аквакультуры, развития техники и технологии добычи и переработки водных биоресурсов. Решения рабочей группы утверждает председатель совета.
4.4. Руководство рабочей группой осуществляет заместитель председателя совета.