На территории Лесного Заволжья Республики Татарстан организовано несколько особо охраняемых природных территорий, где имеются редкие для республики участки высокопроизводительных хвойных лесов, эталонных по генетико-селекционным качествам. В Арском и Балтасинском муниципальных районах расположен Сурнарский охотничий заказник, по своему назначению близкий к природному заказнику зоологического профиля. Ряд его кварталов в 2001 году преобразован в иные охраняемые природные объекты - природный заказник "Балтасинский" и памятник природы "Аю урманы".
Природный заказник "Балтасинский", располагаясь на высоком водоразделе между реками Казанкой и Шошмой, имеет большое водоохранное значение. Видовое разнообразие флоры некоторых лесных массивов, несмотря на явно производный их характер, достаточно полно отражает специфику коренных темнохвойно-широколиственных лесов региона.
Природный заказник "Ашит" - первый в республике природный комплексный заказник (1977). Расположен в пойме р. Ашит. Заказник имеет большое значение для сохранения мест присады водоплавающих птиц. Его площадь - 2,7 тыс. гектаров. В период половодья на мелководьях останавливаются более 2000 гусей и уток. Долина р. Ашит в верхнем течении является ценным природным участком, имеющим особое значение для сохранения всех слагающих ее компонентов. На территории заказника отмечено более 100 видов птиц, 12 из которых внесены в Красную книгу Республики Татарстан.
На территории Зеленодольского и Верхнеуслонского муниципальных районов в 1998 году в связи с особой экологической ценностью природной системы р. Свияги, Свияжского залива Куйбышевского водохранилища и прилегающих пойменных участков, где произрастает и обитает 35 видов растений и животных, внесенных в Красную книгу Республики Татарстан, организован природный заказник "Свияжский" на площади 12,5 тыс. гектаров.
Данный участок р. Свияги изобилует островами, которые являются резерватами уникального генофонда растительного и животного мира. Фитоценозы этих островов формируют около 1000 видов высших сосудистых растений, а фаунистический комплекс - около 1500 видов животных. Следует также отметить, что островки и мелководья являются местом для вывода и роста водоплавающей дичи, а благодаря их высокой кормовой емкости здесь в предпромысловый и миграционный периоды концентрируются водоплавающие птицы.
В сентябре 2007 г. Президиум Международного координационного совета Программы The Man and the Biosphere Programme (МАБ) ЮНЕСКО принял решение о включении природного заказника "Свияжский" (Sviazhsky Wetland Area) в качестве кластерного участка в состав Большого Волжско-Камского биосферного резервата.
Особого внимания заслуживает государственный природный заказник регионального значения ландшафтного профиля "Чулпан". Его организация на площади 6 тыс. гектаров обусловлена процессом деградации земель сельскохозяйственных угодий, где главным разрушающим фактором является эрозия. В 1972 году учеными Татарского научно-исследовательского института сельского хозяйства "Нива Татарстана" разработана Программа "Охрана почв и рациональное использование земли", внедрен комплекс природно-восстановительных и почвозащитных мероприятий, использован новый метод экологически сбалансированной системы земледелия. В результате принятых мер произошли существенные перемены как в самом ландшафте, так и в биоразнообразии.
В Агрызском муниципальном районе еще в 1997 году одним из первых в республике организован природный заказник "Кичке-Тан" на площади 9,8 тыс. гектаров. Территория заказника занята луговыми и лесными сообществами, травяными болотами и сельхозугодьями. В геоботаническом отношении территория находится в зоне хвойно-широколиственных (подтаежных) лесов, сохранившихся в виде фрагментов. Предпосылками его организации явилось отсутствие индустриальных комплексов, мощная гидрологическая сеть естественного и искусственного происхождения. Бесконтрольное рыболовство, охота, стихийный туризм оказывали отрицательное воздействие на природные комплексы. Организация природного заказника "Кичке-Тан" обеспечила условия увеличения биоразнообразия, численности и плотности проживания редких видов животных. В настоящее время в акватории р. Иж отмечено значительное увеличение численности орлана-белохвоста, скопы, гнездование нескольких пар лебедя-шипуна, кулика-сороки. Зарегистрирована зимовка двух особей бурого медведя. Отмечается рост численности ондатры и бобра.