Непосредственный контроль за ходом реализации мероприятий Программы осуществляет Министерство здравоохранения Республики Татарстан.
Территориальные отделы и управления здравоохранения Министерства здравоохранения Республики Татарстан, республиканские медицинские учреждения ежегодно в период сдачи годовых отчетов представляют информацию о выполнении мероприятий Программы и эффективности использования выделенных средств в отдел профилактической помощи населению Министерства здравоохранения Республики Татарстан.