В соответствии с постановлениями Правительства Мурманской области от 01.04.2005 № 113-ПП и от 09.02.2007 № 72-ПП/2 функции разработчика и государственного заказчика данной Программы возложены на комитет по природным ресурсам и охране окружающей среды Мурманской области (далее- комитет). В связи с включением в Программу большого объема работ по реконструкции действующих сетей водоснабжения, было принято решение о разделении Программы на две подпрограммы. Первая включает в себя поиск, разведку, оценку и обустройство подземных источников водоснабжения, вторая - реконструкцию действующих систем водоснабжения. Государственным заказчиком по первой подпрограмме определен комитет, по второй - департамент строительства и жилищно-коммунального хозяйства Мурманской области (далее-департамент). Департамент является и координатором Программы.
Комитет и департамент осуществляют управление Программой, контролируют реализацию мероприятий, ведут ежеквартальную отчетность по реализации Программы, контролируют соответствие запланированных и достигнутых целевых индикаторов, подготавливают ежегодно предложения по уточнению перечня программных мероприятий на очередной финансовый год, уточняют затраты, а также механизм реализации мероприятий: проводят конкурсы по разработке проектно-технической документации по обустройству подземных источников водоснабжения, строительству водоводов и реконструкции действующих систем водоснабжения населенных пунктов Мурманской области, готовят ежегодный доклад о ходе ее реализации.