Департамент рыбной промышленности Мурманской области, являясь государственным заказчиком и координатором Программы, осуществляет координацию действий и контроль за выполнением проектных мероприятий в достижении планируемых результатов. (с изменением на основании постановления Правительства Мурманской области от 30 июля 2008 года № 356-ПП/12)
Департамент рыбной промышленности Мурманской области на основе информации от департамента финансов Мурманской области, других исполнителей программы направляет ежегодно до 1 февраля в департамент экономического развития Мурманской области доклады о ходе выполнения мероприятий Программы и эффективности использования финансовых средств, подготовленные на основе форм и схем, разрабатываемых департаментом экономического развития Мурманской области.(с изменением на основании постановления Правительства Мурманской области от 30 июля 2008 года № 356-ПП/12)
В рамках Программы предусматривается ежеквартальный контроль со стороны Контрольно-счетной палаты Мурманской области за использованием средств областного бюджета предприятиями - участниками Программы.
Для обеспечения мониторинга и анализа хода реализации Программы департамент рыбной промышленности Мурманской области формирует орган оперативного управления реализацией Программы. (с изменением на основании постановления Правительства Мурманской области от 30 июля 2008 года № 356-ПП/12)