3.1. Разработка проектов нормативно - правовых актов для рыбной отрасли, входящих в компетенцию органов государственной власти Мурманской области как субъекта Федерации.
3.2. Выработка предложений по управлению и рациональному использованию водных биоресурсов, отнесенных к федеральной собственности.
3.3. Выработка предложений по управлению и рациональному использованию водных биоресурсов, относящихся к ведению исключительно органов власти Мурманской области и в пределах Соглашения между Правительством Российской Федерации и Правительством Мурманской области о разграничении полномочий по вопросам владения, пользования и распоряжения водными биологическими ресурсами.
3.4. Разработка предложений по стратегии развития рыбохозяйственного комплекса области в соответствии с долгосрочным прогнозом сырьевой базы.
3.5. Внесение предложений для Правительства Мурманской области по формированию объемов поставок рыбной продукции в областные и федеральные продовольственные фонды и установлению хозяйственных связей между потребителями и поставщиками для заключения договоров.
3.6. Участие в подготовке предложений по реализации политики реструктуризации предприятий рыбопромышленного комплекса на территории области.
3.7. Проведение работы по привлечению инвестиций в высокотехнологические предприятия рыбного хозяйства области.
3.8. Участие в разработке и осуществлении антикризисных организационно - экономических мер, направленных на оздоровление положения в рыбопромышленном комплексе, развитие его производственного потенциала в области.
3.9. Содействие развитию предприятий всех форм собственности и хозяйствования, формированию рыночных инфраструктур в рыбном хозяйстве, участие в разработке мер демонополизации предприятий.
3.10. Участие в разработке предложений по совершенствованию продовольственной, ценовой, налоговой и таможенной политики в рыбном хозяйстве.
3.11. Осуществление защиты интересов рыбной отрасли Мурманской области на всех уровнях в пределах своей компетенции.
3.12. Разработка предложений по объему квот добычи водных биоресурсов, необходимых для пользователей Мурманской области, включая совместные предприятия с участием иностранных юридических и физических лиц.
3.13. Участие в разработке проектов федеральных целевых программ по развитию рыбного хозяйства области.
3.14. Разработка предложений для Правительства Мурманской области по распределению и перераспределению между пользователями Мурманской области региональных квот вылова водных биологических ресурсов.
3.15. Обеспечение заказов, по поручению Правительства Мурманской области, на реализацию региональных программ и договоров между участниками внешнеэкономического сотрудничества по направлениям деятельности Комитета.
3.16. Рассмотрение представляемых материалов и подготовка проектов распоряжений Правительства Мурманской области по закреплению рыбохозяйственных водных объектов области или их участков за пользователями водных биоресурсов.
3.17. Разработка и реализация программ развития прибрежного промысла и на его базе береговой инфраструктуры.
3.18. Координация работ по искусственному воспроизводству рыбных запасов, добыче и переработке нетрадиционных гидробионтов, осуществлению программ развития инфраструктуры рыбного хозяйства области.
3.19. Разработка предложений по формированию основных принципов политики в области международного и межрегионального сотрудничества по рыболовству.
3.20. Комитет осуществляет другие функции, делегируемые ему Правительством области.
3.21. Комитет осуществляет лицензирование деятельности по организации спортивного и любительского лова ценных видов рыб, водных животных и растений на территории Мурманской области. (дополнение на основании постановления Правительства Мурманской области от 15.05.03 г. № 146-ПП)