Территория заповедника и его охранной зоны расположена в следующих границах:
Северная граница - из точки севернее 1 км от кордона Красная Ламбина идет на запад 30 км южнее горы Мочесньюначорр, захватывая озера Урд, севернее горы Контведынч до верховьев реки Вацуай по северной стороне кварталов 59 - 69 бывшей территории Мончегорского лесхоза. Далее граница поворачивает на север и идет 8 км по восточной стороне кварталов 37, 305 (бывшая территория Кольского лесхоза) до горы Ольче, поворачивает на запад (2 км) между кварталами 305 и 265 не доходя реки Койст (1 км) делает поворот на Север (4 км) между кварталами 264 и 265 до предгорьев южного склона г. Ольче; поворачивает на запад (8 км) между кварталами 264, 263/221, 220, не доходя до оз. Койст, поворачивает снова на север до пересечения квартальных просек 180, 181/219, 220 (восточнее р. Печа 1 км). Отсюда граница идет на запад вдоль южного склона горы Пыршминуайвенч до квартального столба кварталов 171 - 172/210 - 211 (место пересечения Вувской магистрали).
Западная граница - идет от квартального столба 171 - 172, 210 - 211 на юг 4 км по квартальной просеке 210 - 211; поворот на запад 2 км до пересечения квартальной просеки 209 - 210/251 - 252 (до Вувской магистрали) поворот на юг 4 км по квартальной просеке между кварталами 251 - 252. От квартального столба кварталов 251 - 252/294 - 295 поворачивает на восток 4 км по квартальным просекам между кварталов 252 - 253/295 - 293 до южного склона горы с отметкой 453 м (квартальный столб 253 - 254/296 - 277). От указанной точки поворачивает строго на юг и идет по квартальным просекам между кварталами 296 - 297, 30 - 31, 72 - 73, 114 - 115, 162 - 163 (бывшей территории Кольского лесхоза) до р. Березовая (Роговая). Далее граница идет вверх по р. Березовая (Роговая), затем от квартального столба 30 - 31/42 - 43 бывшей территории Зашейковского лесхоза на юг по квартальной просеке 42/43 4 км, поворачивает на восток по квартальной просеке 43/61 (2 км) от квартального столба 43 - 44/61 - 62 на юг по квартальной просеке 4 км, поворачивает на восток и проходит по южной стороне кварталов 62 - 65 до квартального cтoлбa 65 - 66/83 - 84; от него на юг по западной стороне квартала 84 4 км; поворачивает на восток по южной стороне кв. 84 (2 км), выходит на старую границу заповедника, по ней на юг по западной стороне кварталов 120 - 139 заповедника до Пиренгского водохранилища.
Южная граница от точки пересечения западной границей заповедника Северного берега Пиренгского водохранилища граница идет по воде в 500 м от берега на восток до пролива, соединяющего водохранилище с Охтозером; по южному берегу Охтозера до противопожарной просеки между Охтозером и Чунозером; южными берегами Чунозера и реки Нижняя Чука до залива Вочеламбина.
Восточная граница идет от северного берега залива Вочеламбина на север до автодороги Мурманск - Ленинград (1321 км) по дороге до оз. Монча, юго-западным берегом оз. Монча, южным берегом реки Ярви, западным берегом оз. Пагель, юго-западным берегом оз. Красная Ламбина и далее в точку севернее 1 км кордона Красная Ламбина.