Мероприятия Программы предполагается реализовывать за счет средств федерального бюджета (за счет проектов, включенных в федеральные целевые программы), областного бюджета, муниципальных бюджетов, привлеченных средств (за счет средств фонда социального страхования, платных услуг).
Объемы финансирования программных мероприятий за счет средств областного бюджета согласовываются заказчиком Программы с органами исполнительной власти администрации области и подлежат ежегодному уточнению. Использование финансовых средств предусматривается на конкурсной основе в соответствии с действующим законодательством.
Общая финансовая потребность на реализацию Программы в течение пяти лет составляет 633 992 тыс. рублей, в том числе из бюджета области - 488 526,2 тыс. рублей. Суммы ежегодного финансирования Программы из бюджета области определяются при подготовке бюджета на очередной финансовый год.
Финансовая потребность в средствах областного бюджета по годам в ценах 2003 года составляет:
2004 год - 98 042,5 тыс. рублей,
2005 год - 99 564,5 тыс. рублей,
2006 год - 101 642, 6 тыс. рублей,
2007 год - 94 457, 1 тыс. рублей,
2008 год - 94 819,5 тыс. рублей.
Финансовые средства областного бюджета предполагается использовать на укрепление материально-технической базы лечебно-профилактических учреждений, оснащение их современным лабораторным и диагностическим оборудованием, обеспечение лечебных учреждений лекарственными средствами, а также на санитарно-гигиеническое воспитание населения в вопросах профилактики социально значимых заболеваний.