Граница Кронштадтского административного района проходит от уреза воды начала северной части комплекса защитных сооружений в поселке Горская, далее по трассе защитных сооружений до острова Котлин, включая остров Котлин, ограниченный береговой линией Невской губы и Финского залива, далее до уреза воды острова Котлин с южной стороны окончания южного участка защитных сооружений, далее по трассе южного участка защитных сооружений до береговой черты начала южного участка трассы защитных сооружений в поселке Бронка. Кроме того, в состав Кронштадтского административного района входят Кронштадтские форты, ограниченные береговой линией:
форт 7-й Северный
форт 6-й Северный
форт 5-й Северный
форт 4-й Северный
форт 3-й Северный
форт 2-й Северный
форт 1-й Северный
форт Обручев
форт Тотлебен
форт Александр I (Чумный)
форт Петр I
форт Кроншлот
форт Павел I
форт Пороховой
форт 3-й Южный
форт 2-й Южный
форт 1-й Южный,
а также отдельно стоящий в Финском заливе маяк Толбухин.