Основными задачами Фонда являются:
- финансирование программ и научно-технических проектов по улучшению качества окружающей природной среды Санкт-Петербурга и обеспечению экологической безопасности населения Санкт-Петербурга;
- аккумуляция средств на осуществление природоохранных мероприятий и программ;
- экономическое стимулирование бережного и эффективного использования природных ресурсов;
- финансирование строительства природоохранных сооружений;
- финансирование мероприятий по возмещению потерь в окружающей природной среде и компенсации причиненного ей вреда.