4.1. Совет возглавляется губернатором Санкт-Петербурга или по его поручению первым вице-губернатором Санкт-Петербурга председатель Комитета экономики и промышленной политики.
4.2. В состав Совета, по согласованию, включаются представители неподведомственных губернатору Санкт-Петербурга организаций: общественных объединений, союзов и ассоциаций малого предпринимательства, структур поддержки малого предпринимательства; ученые, авторитетные предприниматели. Персональный состав Совета утверждается председателем Совета.
4.3. Для организации работы Председатель Совета назначает двух заместителей.
4.4. При Совете создается Комиссия представителей административных районов, которая формируется по рекомендациям глав администраций и общественно-экспертных Советов районов и работает при непосредственном взаимодействии с отделом поддержки предпринимательства Комитета экономики и промышленной политики. Председатель Комиссии избирается ее членами сроком на один год.
4.5. Ответственный секретарь Совета является сотрудником группы по обеспечению деятельности Совета и входит в состав Совета.