Основными задачами комиссии являются:
2.1 Сбор и анализ данных о редких и находящихся под угрозой исчезновения видах животных, растений и грибов, занесенных и рекомендованных к занесению в Красную книгу Пермской области.
2.2 Подготовка предложений по занесению в установленном порядке в Красную книгу Пермской области (или исключению из нее) видов животных, растений или грибов.
2.3 Подготовка к изданию, содействие изданию и распространение Красной книги Пермской области и приложений к ней.
2.4 Научно-консультативная координация и организация мониторинга состояния популяций видов, занесенных в Красную книгу Пермской области.
2.5 Подготовка предложений по специальным мерам охраны, включая организацию специализированных особо охраняемых природных территорий и создание генетических банков, с целью сохранения генофонда видов животных, растений и грибов, занесенных в Красную книгу Пермской области.
2.6 Рецензирование программ исследовательских и научно-практических работ с редкими видами растений и животных.
2.7 Курирование методического центра по подготовке региональных Красных книг.