3.1.1. разрабатывает региональные программы по охране, воспроизводству и рациональному использованию природных ресурсов области, участвует в их реализации, а также осуществляет функции государственного заказчика по региональным программам в сфере использования и воспроизводства природных ресурсов;
3.1.2. участвует в разработке и реализации федеральных программ по охране, восстановлению и использованию природных ресурсов области;
3.1.3. разрабатывает предложения по совершенствованию законодательства в сфере природопользования, формирования и ведения комплексной базы данных о состоянии и использовании природных ресурсов, отнесенных к ведению главного управления, мониторинга природных ресурсов и экологической безопасности, а также проекты законов и иных нормативных правовых актов области в этой сфере;
3.1.4. устанавливает в соответствии с федеральным и областным законодательством территориальные правила, лимиты и нормативы в сфере использования природных ресурсов;
3.1.5. готовит предложения по перечню объектов природопользования, передаваемых в собственность области или имеющих областное значение, представляет его для рассмотрения губернатору области и по его поручению согласовывает этот перечень с соответствующими федеральными органами и ведомствами;
3.1.6. в пределах предоставленных полномочий участвует в подготовке условий и проведении конкурсов (аукционов) по предоставлению права недро-, водо-, лесопользования и принимает решения по результатам проведенных аукционов (конкурсов);
3.1.7. в пределах установленной компетенции согласовывает условия, связанные с недро- и водопользованием при выдаче лицензий, утверждает в установленном порядке сборы за выдачу лицензий на водопользование, а также контролирует соблюдение лицензиатами лицензионных требований и условий;
3.1.8. готовит предложения по размерам ставок регулярных платежей за пользование природными ресурсами;
3.1.9. участвует в разработке предложений по расходованию областных целевых бюджетных фондов, средств областного бюджета на мероприятия по восстановлению, развитию и охране всех видов природных ресурсов, обеспечивает контроль за их целевым использованием;
3.1.10. осуществляет методическое руководство и контроль за деятельностью органов местного самоуправления городов (районов) области по осуществлению ими предоставленных законодательством полномочий по вопросам использования и охраны природных ресурсов;
3.1.11. утверждает проекты водоохранных зон по представлению бассейнового и (или) территориального специального уполномоченного государственного органа управления использованием и охраной водного фонда Министерства природных ресурсов Российской Федерации.