4.1. Руководство управлением осуществляется на основе сочетания единоначалия и коллегиальности.
4.2. Управление возглавляет начальник, имеющий высшее образование, назначаемый на должность и освобождаемый от должности губернатором области.
4.3. Начальник осуществляет общее руководство деятельностью управления и несет персональную ответственность за выполнение возложенных на управление задач.
4.4. Начальник имеет заместителя, назначаемого на должность и освобождаемого от должности начальником управления по согласованию с заместителем губернатора области, осуществляющим общее руководство управлением. На время отсутствия начальника исполнение его обязанностей возлагается на заместителя начальника.
4.5. Начальник:
4.5.1. издает в пределах своей компетенции приказы, дает указания и распоряжения, подлежащие обязательному исполнению работниками управления, проверяет их исполнение;
4.5.2. представляет штатное расписание на утверждение губернатора области;
4.5.3. распределяет обязанности между заместителем начальника управления, руководителями структурных подразделений и работниками; утверждает положения о структурных подразделениях управления и должностные инструкции работников;
4.5.4. назначает на должность и освобождает от должности работников управления;
4.5.5. распоряжается средствами управления в пределах утвержденных смет и выделенных ассигнований;
4.5.6. утверждает размер платы за конкурсную документацию;
4.5.7. представляет в установленном порядке отличившихся работников управления, аптечных работников области к государственным наградам, почетным званиям, присвоению квалификационных разрядов. Объявляет поощрения и налагает дисциплинарные взыскания работникам управления;
4.5.8. согласовывает назначение и освобождение руководителей государственных областных унитарных предприятий, осуществляющих фармацевтическую деятельность;
4.5.9. представляет интересы управления без доверенности, заключает договоры и соглашения, выдает доверенности от имени управления, ведет прием населения по вопросам, входящим в компетенцию управления;