Центром всей деятельности Мемориального музея должна быть просветительская работа, распространение понимания того, что одним из главных моментов тоталитаризма является идеологический монополизм, органическая нетерпимость и воинственность к инакомыслию, ставшие в конце концов доминирующей чертой не только идеологизированного, но и обыденного сознания; что преодоление его лежит в воспитании плюралистических ценностей и основополагающих идей приоритета прав человека.
Задача музея - не просто разоблачение практики тоталитаризма на самых вопиющих примерах репрессивной истории, а анализ преступности всей идеологии большевизма, распространение идей правового, гражданского, плюралистического общества, концепций демократии и самоуправления.