Государственным заказчиком Программы является комитет агропромышленного комплекса Курской области, который в ходе реализации Программы осуществляет координацию деятельности исполнителей, ее нормативное и методическое обеспечение.
Государственный заказчик осуществляет подготовку предложений по объемам и условиям предоставления субсидий, выделяемых на реализацию мероприятий Программы, взаимодействует с федеральными и областными органами исполнительной власти, учреждениями, предприятиями и хозяйствами всех организационно-правовых форм собственности.
С учетом выделяемых средств государственный заказчик ежегодно уточняет целевые показатели и затраты по мероприятиям Программы, механизм их реализации, состав исполнителей, а также вносит в областную Думу предложения по корректировке, продлении срока реализации Программы либо прекращении ее выполнения.
По истечении срока реализации Программы государственный заказчик подготавливает доклад о ее выполнении и об эффективности использования средств за весь период реализации Программы и представляет его в Правительство Курской области и Курскую областную Думу.