Текущее управление и контроль за реализацией Программы осуществляют ГП "Астраханские сельскохозяйственные водопроводы" и ГУ "Астраханжилкомхоз", которые взаимодействуют с федеральными органами исполнительной власти и Администрацией Астраханской области.
ГП "Астраханские сельскохозяйственные водопроводы" и ГУ "Астраханжилкомхоз" ежегодно до 1 февраля направляют на имя Главы Администрации области доклад о привлечении бюджетных средств и внебюджетных источников для реализации мероприятий Программы в установленные сроки.
При сокращении объемов финансирования Программы из федерального бюджета государственные заказчики корректируют перечень мероприятий и вводимых объектов на очередной хозяйственный год, определяют приоритеты и принимают меры по привлечению внебюджетных источников для финансирования Программы.