5.1. Департамент возглавляет начальник, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором Астраханской области. Начальник департамента является по должности заместителем Главы Администрации Астраханской области.
5.2. Начальник департамента осуществляет руководство деятельностью департамента на основе единоначалия и несет персональную ответственность за выполнение возложенных на департамент задач и функций.
5.3. Начальник департамента имеет первого заместителя и заместителей, назначаемых на должность и освобождаемых от должности Губернатором Астраханской области по предложению начальника департамента.
5.4. На время отсутствия начальника департамента его обязанности исполняет первый заместитель начальника департамента, а в отсутствие последнего - один из заместителей начальника департамента.
5.5. Начальник департамента:
- утверждает смету расходов на содержание департамента в пределах ассигнований, предусмотренных законом Астраханской области об областном бюджете на очередной финансовый год;
- представляет на утверждение Губернатору Астраханской области Положение о департаменте сельского хозяйства Астраханской области, предельную численность и фонд оплаты труда работников департамента;
- утверждает структуру и штатное расписание департамента в пределах утвержденной Губернатором Астраханской области предельной численности работников департамента и фонда оплаты на их содержание;
- распределяет обязанности между заместителями начальника и руководителями структурных подразделений департамента и координирует их деятельность;
- утверждает положения о структурных подразделениях департамента, должностные инструкции работников департамента;
- принимает на должность и увольняет с должности работников департамента;
- координирует и контролирует деятельность департамента;
- действует без доверенности при представлении интересов департамента во всех органах и организациях, включая судебные, подписывает заявления и жалобы в суды общей юрисдикции и арбитражные суды, обжалует акты судов общей юрисдикции и арбитражных судов, выдает доверенности;
- вносит в установленном порядке предложения о награждении работников АПК Астраханской области государственными наградами, почетными грамотами Министерства сельского хозяйства Российской Федерации и Губернатора Астраханской области;
- является распорядителем кредитов департамента, утверждает сметы расходов и подписывает условия премирования и материального стимулирования работников департамента;
- назначает на должность и освобождает от должности руководителей областных государственных учреждений и предприятий, входящих в сферу АПК;
- издает приказы и распоряжения, обязательные для работников департамента и областных государственных организаций, учреждений и предприятий, входящих в систему АПК области, дает рекомендации органам местного самоуправления по вопросам, входящим в компетенцию департамента;
- осуществляет иные полномочия в соответствии с действующим законодательством.