Основными задачами комитета являются:
2.1. Проведение государственной политики в сфере организации обеспечения населения, лечебно - профилактических учреждений и иных организаций на территории области лекарственными средствами и изделиями медицинского назначения.
2.2. Регулирование фармацевтической деятельности и деятельности, связанной с оборотом наркотических средств и психотропных веществ, координация и контроль за работой субъектов обращения лекарственных средств независимо от формы собственности, взаимодействие с органами здравоохранения различных уровней; осуществление контроля на территории области за выполнением лицензионных требований и условий в соответствии с нормативными правовыми актами Российской Федерации и Астраханской области.
2.3. Осуществление контроля в пределах полномочий за качеством лекарственных средств и изделий медицинского назначения, реализуемых через фармацевтические организации, расположенные на территории Астраханской области.